মহান মুক্তিযুদ্ধে ছেলে শাফী ইমাম রুমী শহিদ হন। সেই থেকে জাহানারা ইমামকে শহিদ জননী বলে সম্বোধন করেন বীর মুক্তিযোদ্ধারা। স্বাধীন বাংলাদেশে যুদ্ধাপরাধীদের দাবিতে তিনি আন্দোলন গড়ে তোলেন।

তার নেতৃত্বে ১৯৯২ সালে ঐতিহাসিক সোহরাওয়ার্দী উদ্যানে বসে গণ আদালতে। যেখানে প্রধান যুদ্ধাপরাধী, জামায়াত নেতা গোলাম আজমের মৃত্যুদণ্ডে দণ্ডিত করা হয়।

একাত্তরের যুদ্ধাপরাধীদের বিচার এবং অসাম্প্রদায়িক বাংলাদেশ গঠনের দাবিতে আমৃত্যু লড়াই করেছেন তিনি। জাহানারা ইমামের লেখা ‘একাত্তরের দিনগুলি’ বাংলাদেশের মুক্তিযুদ্ধের অন্যতম দলিল।

দুরারোগ্য ক্যান্সারে আক্রান্ত হয়ে ১৯৯৪ সালের ২৬শে জুন তিনি যুক্তরাষ্ট্রের একটি হাসপাতালে মারা যান।